総研大: Bioinformatics概論

中村保一他 (2017版)

コンテンツ

1. イントロダクション (実習・関連動画 3hrs）

2. ゲノム解析総論 (実習・関連動画 3hrs）

3. 配列類似検索の基礎 (実習・関連動画 3hrs）

4. 遺伝子機能予測 (実習・関連動画 3hrs）

5. 遺伝研スパコン活用基礎 (実習・関連動画 6hrs）

推薦図書・コンテンツ

• 書籍「次世代シークエンサーDRY解析教本-細胞工学別冊-」（Macで全部できる）
• 動画 平成28年度 次世代シークエンサ(NGS)ハンズオン講習会（バイオインフォマティクス人材育成カリキュラム）
• サイト (Rで)塩基配列解析（東大・門田先生）
• 書籍「トランスクリプトーム解析」（上記のサイトの書籍版）

謝辞

• 参照ゲノム、RNA-seqリードの選択、スクリプトは2014年ゲノム支援講習会の千葉大学・高橋さんの講習内容を踏襲させていただきました。
• 説明の流れは「Dry解析教本」岩手医科大学・大桃さんの章を参考にさせていただいてきました。
• 本文中ターミナルのイメージを表示するのに、WordPress プラグイン「WP Code Highlight.js」を利用しています。

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レポート課題: *