総研大: Bioinformatics概論
中村保一他 (2017版)
コンテンツ
- 1. イントロダクション (実習・関連動画 3hrs)
- 2. ゲノム解析総論 (実習・関連動画 3hrs)
- 3. 配列類似検索の基礎 (実習・関連動画 3hrs)
- 4. 遺伝子機能予測 (実習・関連動画 3hrs)
- 5. 遺伝研スパコン活用基礎 (実習・関連動画 6hrs)
推薦図書・コンテンツ
- 書籍「次世代シークエンサーDRY解析教本-細胞工学別冊-」(Macで全部できる)
- 動画 平成28年度 次世代シークエンサ(NGS)ハンズオン講習会(バイオインフォマティクス人材育成カリキュラム)
- サイト (Rで)塩基配列解析(東大・門田先生)
- 書籍「トランスクリプトーム解析」(上記のサイトの書籍版)
謝辞
- 参照ゲノム、RNA-seqリードの選択、スクリプトは2014年ゲノム支援講習会の千葉大学・高橋さんの講習内容を踏襲させていただきました。
- 説明の流れは「Dry解析教本」岩手医科大学・大桃さんの章を参考にさせていただいてきました。
- 本文中ターミナルのイメージを表示するのに、WordPress プラグイン「WP Code Highlight.js」を利用しています。
レポート課題: *