DDBJ Sequence Read Archiveの統計を視覚化しています。
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1 Oct 2011時点
グラフ作成手順
1. DRA/ERA/SRA単位で、submission.xmlとexperiment.xmlが存在する物を抽出。
2. submission.xmlから登録申請年月を抽出
3. experiment.xmlから最初のinstrument_modelを抽出。
(※複数のinstrument_modelがあってもカウントしない)
4. instrument_modelはメーカ毎に分けたがHiSeq2000のみ切出。
注意:2008年にHiSeq2000がカウントされた理由は、submissionが2008年で2011年にrunが登録されている為。(1000 genomesなど)
<配分率>
グラフ作成手順
DBCLS SRA統計(http://sra.dbcls.jp)の統計量から、instrument_modelやresearch分野をマージして円グラフ化。